病毒性脑炎在临床上可以治疗，且疗效大多较好，但如果是单纯疱疹病毒性脑炎，则预后稍差。病毒性脑炎的治疗包括对症支持治疗和防治并发症治疗，对症治疗比如颅内压增高引起的头痛，可适当给予脱水药物治疗，必要时加用止痛药物，支持治疗主要是加强营养、维持水电解质平衡等。
病毒性脑炎通常还可用抗病毒治疗，可明显缩短病毒性脑炎的疗程，应该酌情使用。如果是单纯疱疹性病毒性脑炎，则可用激素治疗。
