直肠息肉和痔疮主要从临床表现和辅助检查上区分，直肠息肉临床上主要表现为大便不规律，比如次数增加、脓血便、粘液便、小腹部和尾椎骨前方胀痛，出血淡红色，因为有肠粘液混合。痔疮临床表现主要是肛门疼痛、痔核脱出，出血以鲜红色点滴状或者喷射状，容易合并便秘，很少有腹泻。做直肠指检时痔疮在肛门一周，痔核张力相对比较高，质偏硬，直肠息肉感觉偏软、光滑，距离肛门距离约两厘米以上。通过直肠镜可以明确判断，痔疮的痔核内有血液，而直肠息肉血液不明显。
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