流感病毒和新型冠状病毒肺炎，在临床症状、辅助检查和预后上都不相同。普通的流感病毒，胸片或肺CT很少出现间质性改变，而新型冠状病毒肺炎会出现典型的以外周带为主的间质性改变。
普通流感病毒新冠病毒抗体是阴性，而新型冠状病毒肺炎的患者，新冠病毒抗体多为阳性。普通的流感病毒经过对症的治疗，预后非常好，而新型冠状病毒肺炎大部分患者预后较好，少部分的患者可留有后遗症，甚至可出现死亡。
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