做完普通的电子胃镜检查后会难受大约数分钟至半小时左右，表面麻醉药全部失效以后基本上能够恢复正常，不过也存在有一定的个体差异，可能有少部分人总感觉到反胃、恶心甚至会影响进食，这是由于心理因素造成的，不会影响身体健康，而且胃镜检查是安全的，不会存在有传染病，所以受检查者可以放心。如果做的是无痛的电子胃镜检查，可能会因为麻药的副作用，少部分人会出现头晕、胸闷、恶心、呕吐、反胃、纳差等不适，上述症状大约持续半天到一天左右也会自行消失，如果是严重的不适症状则需要就诊。
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