遗传代谢病对健康寿命的影响不大，患者的生活和工作不会受到影响，可以正常生活。
临床上常见的遗传代谢性疾病有糖尿病、高脂血症、肥胖症、高尿酸血症，这些疾病都具有一定的遗传性，同时也都存在代谢紊乱。糖尿病患者如果按着糖尿病的五驾马车严格控制血糖，尽量减少并发症的出现，就能跟正常人一样生活、工作，对寿命的影响并不是很大。同理，高脂血症、肥胖症、高尿酸血症等遗传代谢性疾病，只要进行认真的控制，进行降脂、减重、降低尿酸等一些处理的方式，患者都能跟正常人一样，对寿命的影响不是很大。主要是靠患者的自律性以及依从性，使疾病向好的方向转化。
应注应注意，大多数遗传代疾病的治疗原则是减少代谢缺陷造成的毒性物质蓄积，补充正常需要物质或进行基因医疗。大多数遗传代谢病以饮食治疗为主，部分疾患可通过维生素、辅酶等进行治疗。
