一部分反流性食管炎患者会出现咳嗽症状，反流性食管炎典型症状是烧心、反酸、反食和胸骨后疼痛。还有一些患者临床表现不典型，其中呼吸道症状容易被误诊或者漏诊。由于反流物被吸入气管、肺部，容易引起支气管炎、吸入性肺炎、肺间质纤维化，还有肺不张，可以出现咳嗽、哮喘等症状，尤其是在负重劳作时，更容易发生这些问题。
对于一些没有反流症状，而仅表现为呼吸道症状者，就不容易被识别。因此，对于长期慢性咳嗽和哮喘的患者，长期应用抗生素、止咳药又没有效果，在排除其他疾病的可能后，要考虑到反流性食管炎这个病。
