气管镜又可以称为纤维支气管镜，纤维支气管镜可以确诊部分气管内膜、支气管内膜的结核，也可以确诊一些肺结核导致的管内肉芽肿。可以通过纤维支气管镜局部的活检或者刷检，如果找到了结核杆菌，组织学的活检找到了结核的特征性病理改变，如淋巴细胞的渗出、结核的结节形成，尤其是内上皮样细胞、朗罕氏巨细胞、淋巴细胞、纤维组织包裹，而导致的类上皮肉芽肿，是肺结核典型的病理改变。
通常通过这几种方法，对支气管内膜结核、气管内膜结核、肺结核导致的肉芽肿，以及导致可能有干酪样坏死等可以确诊。但是有些肺结核患者的病灶并不在管内，而是在管外，通过纤维支气管镜未必能获得肺结核确诊的诊断依据。
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