通常胃息肉的癌变率较低，大部分胃部息肉可能属于胃底腺息肉以及增生性息肉，癌变的风险较小，与腺瘤不同，因此胃底息肉不一定会癌变，至于真正是否为癌变应取决于目前所处的阶段。大部分良性息肉不容易癌变，即使癌变也会需要漫长的时间，可能至少10年以上。若胃腺瘤性息肉已经发展到癌前病变的阶段，可能存在几年之内癌变的可能性。
胃息肉与肠息肉不同，若出现较小的胃息肉，并非必须进行处理。但大部分肠息肉建议处理，应结合具体情况，通过活检进行明确病理，通常如良性胃底腺息肉，则无需进行处理，可以观察并随访。针对较大的息肉，如增生性息肉，可能存在癌变的可能性，此时应需要进行内镜切除。部分胃增生性息肉与幽门螺杆菌的感染可能存在关系，可以通过根除幽门螺杆菌治疗。
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