肺泡灌洗液细胞检查主要是针对于肺部的病变，包括感染性因素和非感染性因素的病变进行明确、治疗。临床上对于出现的肺部病原体的感染，无法明确其类型，比如真菌、结核分枝杆菌等，可以在灌洗液中查找细胞，甚至做病原体培养明确。对于肺泡蛋白沉积症可以通过肺泡灌洗，达到治疗目的，同时还可以在灌洗液细胞中找到蛋白碎片，明确诊断。此外，对于占位性病变的肺部疾病，比如支气管肺泡癌，可以通过灌洗液查找癌细胞，不仅可以明确诊断，还可以明确病情和疾病类型，及时治疗。
