细菌性脑膜炎，其后遗症是根据其是否能及时诊断、治疗。只要是正规治疗，多数患者不会留下后遗症，少数情况下因为出现脑脓肿，所以导致脑功能区受累及，患者会有记忆、语言、肢体运动导致的后遗症，甚至于会有癫痫的长期发作。这些并发症多数经过治疗后可逐渐缓解，但是有些后遗症为终身性。所以对于细菌性脑膜炎，甚至于化脓性脑脓肿患者，治疗一定要用强杀菌剂，要使用在脑脊液浓度较高，能透过血脑屏障的抗菌药物，而且用杀菌剂最好是两种药物联合使用，疗程、剂量要足，才能尽快将细菌清除，不留后遗症。
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