流行性腮腺炎是全身系统性疾病，全身多个脏器都可以受到损伤。
常见并发症有脑膜脑炎、胰腺炎、卵巢炎、睾丸炎等，具体分析如下：
1、脑膜脑炎：通常在发病7天左右出现头疼、呕吐、惊厥、抽搐、颈项强直等表现，也可以出现表现为嗜睡；
2、胰腺炎：可以表现为中上腹疼痛，压痛，伴有发热、腹胀、呕吐等。
3、睾丸炎：可以出现患侧睾丸肿胀、疼痛，患侧阴囊皮肤发红、水肿，较少累及对侧睾丸；
4、卵巢炎：可以表现为下腰部酸痛以及下腹部卵巢部位压痛。
5、其它：还可以引起甲状腺炎、乳腺炎、肺炎、肾炎、肝炎、心肌炎等，对于眼睛也可以导致泪囊炎和虹膜炎、虹膜睫状体炎等；也可以引起耳聋，主要是损伤到听神经，引起前庭神经炎和迷路炎；也可以出现关节炎，还可以出现血小板减少等并发症。
