胚胎停育原因非常多，临床上比较常见的原因就是胚胎染色体异常。胚胎的染色体异常有可能是遗传原因导致，也有可能是偶然发生的染色体畸变导致的胚胎停育。如果是遗传原因导致的染色体问题，导致胚胎停育，需要检查父母双方的染色体是否存在染色体遗传性疾病，并寻找是否是存在治疗的方法可避免再次胚胎停育；如果是偶发的染色体畸变导致的胚胎停育，则无需进行特殊治疗，只是一个偶发事件。
引起胚胎停育的原因还有可能会存在风湿免疫系统疾病，临床上常见的是抗磷脂抗体综合征或者系统性红斑狼疮，很容易导致胚胎停育。评估的方法也比较简单，进行免疫指标检测，再结合患者的病史即可确诊。
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