大便味道恶臭，主要是因胃肠道功能异常，引起消化不良所致。胃肠道对食物的处理出现功能性下降，造成食物中部分未消化的蛋白质残留在粪便中。而粪便在肠道长途运输过程中，细菌会对残留在大便中的蛋白质进行发酵分解，导致肠道中产生过多味道强烈的气体，包括硫化物或氨气等。
判断肠道是否对食物中的蛋白质进行彻底消化，可通过观察大便性状确定。排便后大便立刻沉到水底，说明大便中存在未经消化的蛋白质，如果大便在水面上漂浮一段时间后逐渐下沉，说明食物中的绝大部分蛋白质已经被消化、利用、吸收，也表明胃肠道功能正常。
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