单心室手术治疗效果因单心室疾病的程度会有很大的差异。
如果单心室的患者房室瓣和动脉瓣膜发育大致正常，主动脉和肺动脉位置异常不严重，而心室发育也较好，同时没有房间隔缺损，没有二尖瓣和三尖瓣闭锁，没有腔静脉移位和狭窄，没有主动脉弓中断等其他异常的话，可以进行心室分隔手术，而这样的手术可以完全治愈。
单心室因而和无先天性心脏病的人的寿命是一样的。
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