目前面肌痉挛的主流治疗方式是微血管减压手术，此手术是微创手术，但在神经外科范围内属于三级手术，手术较精细，也存在一定的风险。其较常见的两个并发症是听神经的损伤和面神经的损伤，因为面神经与听神经彼此靠近，在减压时，可能牵拉或术中的热凝可能会损伤面、听神经，听神经损伤后，可能会出现听力的下降、耳鸣等并发症，极少数的患者可能引起手术一侧的耳听力完全丧失，但是概率较小；第二种并发症是面瘫，面瘫发生的概率通常是4%-5%，但是大部分在半年内可以恢复，仅有极少数的患者会出现永久性的面瘫；其他的手术并发症较少见，但是可能较严重，包括颅内出血、颅内脑梗塞；还有一些其他较小的并发症，包括切口感染、脑脊液瘘，此类并发症较少见，若出现可以通过二次治疗进行治愈。
