胸腺肽是一种免疫调节药，副作用主要体现在药物过敏的方面，比如出现全身损害，出现过敏反应、过敏性休克、高热；呼吸系统会出现喉头水肿、哮喘、胸闷、窒息；皮肤会出现皮疹，这些都是因为应用胸腺肽过敏反应而出现。
胸腺肽对于某些人耐受能力差，容易出现恶心、发热、头晕、胸闷、无力等不良反应，有些患者用完之后会有嗜睡的表现。胸腺肽通过肝脏进行代谢，有一部分会有肝脏出现衰竭的表现，在临床中应该在医生的指导下进行应用，防止副作用过多而影响疗效。
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