肥厚性心肌病的治疗首先分三方面，1.方面是对生活上加以指导，一般这类患者应该避免激烈的运动，持重物，屏气，减少猝死的发生。
2.同时在用药方面也是有很多药物是相对禁忌的，对于增强心肌收缩力和减少心脏的负荷，如洋地黄，硝酸酯类药物和利尿剂是尽量慎用的，目前主张使用β受体阻滞剂和钙通道阻滞剂，减少左室流出道狭窄和抗室性心律失常。
3.对于严重梗阻的患者，可以考虑介入和手术治疗，植入双腔起搏器，消融或者切除肥厚的室间隔心肌。
对于此类患者，一定要做好长期的随访。
对于其直系亲属进行心电图，超声检查，早期发现家族中存在此类疾病的患者。
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