脚趾甲变厚、变黄最常见的原因是灰指甲，叫甲癣或者甲真菌病，是由真菌感染引起，所以要用抗真菌的药物。但由于指甲的结构特殊性，灰指甲的指甲结构异常，外用药很难渗透进去，所以主要是靠口服药物，如伊曲康唑、盐酸特比萘芬片。
还有湿疹也可以造成指甲变厚，比如甲床有湿疹，会造成指甲异常，可能会有增厚。这种情况要治疗湿疹，但是因为外用药效果不好，要加口服药物。另外，银屑病也可以造成指甲增厚、松碎、变形、变质、变色，需要治疗原发病。具体的原因要到皮肤科做检查诊断，才能进行有效的治疗。
