发烧伴有呕吐、腹泻最常见的原因是急性胃肠炎，可见于病毒、细菌感染引起的肠道炎症，主要是由于进食了被病毒、细菌，或细菌分泌的毒素所污染的食物、水源而感染。如果是病毒感染，患者体温一般表现为中低热，腹痛一般不显著，腹泻主要是以水样泻为主。如果是细菌感染引起的肠道炎症，通常会伴有明显的腹痛，发烧一般多表现为中高热，排便多表现为黏液便、脓血便。
另外可能是呼吸道的感染，有些呼吸道病毒的感染，除了呼吸道的症状以外，还可以出现消化道的症状，表现为呕吐、腹泻，同时伴有呼吸道症状。但也有少见的情况没有明显的呼吸道症状，突出的症状是胃肠道的表现，比如流感病毒可以出现类似的表现，所以还要注意是否是呼吸道病毒的感染。
