自身免疫性脑炎比较常见的受累部位包括颞叶、颞叶内侧、海马、边缘系统、杏仁核、额叶等部位，产生的后遗症状也和这些部位损伤有关，常见以下几种：
1、精神障碍，属于器质性精神障碍，以幻觉、妄想比较多见，还常伴有性格、行为改变，如易激惹、情绪异常等。
2、神经系统功能缺失体征，常见病变部位对侧的肢体偏瘫、偏身感觉障碍，有时会出现言语障碍，表现为失语或者构音障碍。
3、认知功能受损，患者常有近记忆力下降，远记忆有时也受损，学习能力明显下降。
4、癫痫发作，为症状性癫痫，也叫做继发性癫痫，表现形式以部分性发作当中的复杂部分性发作比较多见，有时也会继发全面性强直阵挛发作。
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