如果是药物敏感结核病，治疗疗程是6个月；对于耐药结核病，如果使用的是长疗程，一般是18-24个月。如果是首次发现的耐药结核病，也可以使用超短程治疗，疗程一般是13个月。
抗结核的治疗疗程长，因为结核菌在人体内是持续存在的过程，服用抗结核药物仅仅是把体内敏感结核菌，即现在产生致病作用的结核菌杀灭。结核菌在人体内有各种各样的存在形式，有些结核菌在人体内是休眠状态，现在服用的药物无法杀灭它。只有在体内转化成活跃结核菌之后，服用结核药才能将其杀灭。所以有持续的长疗程，应尽可能把体内各种类型存在的结核菌全部杀灭。
