NT检查和唐氏筛查主要的区别是孕早期使用超声，另一个是在孕中期采血检查，筛查的主要疾病也是不同的。NT检查一般在孕3-4个月之间进行，需要给孕妇做盆腔彩超观察胎儿颈项透明层的厚度，如果颈项透明层的厚度过大，有可能提示胎儿患有神经管畸形，比如脑积水、脊柱裂等等。唐氏筛查是孕中期采用母亲血液做筛查，主要筛查的范围包括21三体综合征以及23三体综合征等等，是遗传基因疾病问题的检查，两者本质上是有很大区别的。
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