急性胃肠炎是肠道菌群失调的常见病因，因不良生活习惯，如进食大量刺激性食物或不洁食物，导致胃肠道炎症。菌群失调的常见症状包括腹泻、便秘，以及发热、恶心、呕吐、浑身无力等伴随症状。出现以上症状时，排除急性胰腺炎、急性胆囊炎、急性阑尾炎等疾病后，才可考虑为胃肠道菌群失调。大便细菌培养，也可以直接判断患者是否为菌群失调。
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