脑血管造影是一项检查，整体风险性很低，但属于创伤性检查。临床当中最常见的风险是缺血性事件，比如术中因为导管的刺激造成的血管痉挛，导致脑部缺血。还有继发于导管导丝引起的血栓栓塞或者是气栓，导管导丝通过斑块时造成动脉斑块的剥落导致脑栓塞。还有穿刺点的出血导致瘀斑、大动脉出血，以及造影剂导致的肾功能异常等。
极少数脑血管造影因为颅内压力的轻微变化，可能会诱发动脉瘤和血管病变处破裂，但是发生率非常低。另外脑血管造影是通过X线检查，X线对人体确实有轻微伤害，也需要注意。
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