直肠给退烧药的危害与口服给药退烧的危害基本一样。二者基本上也都是应用非甾体类抗炎药，直肠给药的具体药物有对乙酰氨基酚或者吲哚美辛，口服应用也主要是这两种，另外还有布洛芬。其危害主要是有可能造成消化道溃疡或者加重消化道溃疡，如果之前有消化道溃疡，有可能出现胃痛加重的情况。
直肠给药也有可能出现过敏的情况，比如出现皮疹，严重的也有可能出现过敏性休克，但这种情况相当罕见，基本不用担心，口服给药同样也有可能出现过敏的情况。直肠给药与口服给药的唯一不同就是它的用药方式，直肠给药有可能会让一些人感觉不舒服，这应该算是直肠给药的一个最大危害。
