临床上常用的确诊肺结核检查主要是痰结核菌检查，又分为痰涂片检查和痰结核菌培养，痰结核菌检查简便、易行，准确性较高，痰中查出结核菌就能确诊患结核病。初次就诊要查三个痰标本，即夜间痰、清晨痰和即时痰，虽然是诊断肺结核的金标准，但阳性率低是美中不足之处。痰结核菌培养结果可信度高，并能做结核菌药敏试验，但需6-8周，所以应用受到限制。如果痰菌涂片阴性的患者可做如下检查，以最初的临床诊断：
一、胸部影像学检查，包括X线和CT，胸部X线检查不但可以早期发现结核病，而且可以确定病灶的部位、性质、范围，了解发病情况及用于治疗效果的判断，胸部CT可以发现较小或隐蔽部位的病变，可以弥补一般X线检查的不足。
二、肺结核病免疫学诊断，常用的有结核菌素试验和γ干扰素释放试验。
三、其他检查，还包括纤维支气管镜检查、胸腔镜和纵隔镜检查。
