做肌电图时会有一定的疼痛感，但是对于大部分病人来说是可以耐受的，有轻度难受的感觉，肌电图由于是使用同心圆征电极插入肌肉后所记录的电活动，因此在操作时患者会有一定的疼痛感觉。肌电图记录的是肌肉安静状态下、不同程度随意收缩状态下以及周围神经受到刺激时，各种电生理特性的电活动。由于肌电图的临床意义较大，因此虽然病人有轻微的疼痛和不适感，还是建议患者进行肌电图检查。肌电图的临床意义有诊断和鉴别神经源性和肌源性损害，还可用于发现临床下病灶和容易被忽略的病变。
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