杀幽门螺杆菌的副作用，主要有腹痛、腹泻、大便黑、皮疹等表现。治疗幽门螺杆菌一般会使用到四联疗法，药物组合主要是两种抗生素，如阿莫西林、甲硝唑，一种质子泵抑制剂药物，如奥美拉唑、兰索拉唑等，一种铋剂，如枸橼酸铋钾。这几种药物组合后，虽然可以起到根治幽门螺杆菌的作用，但是可能会导致人体肠道的菌群失衡，引起患者出现胃部不适，还会出现腹部胀痛、腹泻等临床表现。
铋剂药物服用后会导致患者出现大便颜色的改变，一般大便会变成深绿色或颜色发黑，这也属于药物的副作用之一。如果患者对药物里面的成分产生过敏，可能会出现药物热、皮疹、皮肤瘙痒、干燥、灼热感、刺痛等临床症状。
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