根除幽门螺杆菌的三联疗法指两种抗生素加一种质子泵抑制剂，常用的抗生素包括甲硝唑、替硝唑、奥硝唑、克拉霉素、左氧氟沙星、呋喃唑酮、阿莫西林、四环素等。质子泵抑制剂包括奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑、艾司奥美拉唑镁等。由于抗生素的广泛应用，幽门螺杆菌对多种抗生素产生耐药，其中对甲硝唑、克拉霉素、左氧氟沙星等耐药率都比较高，呋喃唑酮的耐药率，各地差异也比较大。但是阿莫西林和四环素的耐药率，总体上比较低，临床上应用也比较多。
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