少突胶质细胞瘤需要与低级别星形细胞瘤、胚胎发育不良性神经上皮瘤和大脑胶质瘤病相鉴别：
1、低级别星形细胞瘤：其发病年龄较少突胶质细胞瘤小星形细胞瘤好发于大脑深部，而少突胶质细胞瘤好发于大脑的表浅部位；星形细胞瘤较少突胶质细胞瘤病灶小，占位效应不显著瘤周水肿不明显，且多无明显强化。发生钙化的机会较少，但其发病率远较少突胶质细胞瘤高，有较明显脑回状或块状钙化时，应倾向于少突胶质细胞瘤的诊断。
2、DNET：发病年龄20岁以前，好发于颞叶，常单发，以囊性成分为主，边界清楚，部分病灶内可见到分隔，肿瘤呈三角形征，且病变内有分隔，这两种表现同时具备时强烈提示DNET的诊断，DNET钙化相对少突胶质瘤少见，其显示正常的谱线而少突胶质细胞瘤异常，表观弥散系数值高于少突胶质细胞瘤。
3、大脑胶质瘤病：病灶呈弥漫浸润生长向纵深发展以脑组织肿胀为主，少见囊变坏死出血增强多无强化。
