尿道下裂的原因很多，如果尿道下裂是遗传因素导致的，会与父亲有关。因为遗传因素是性别的分化相关基因发生了突变，导致了尿道下裂，只有这个病因才与父亲有关，其他的病因还有很多。首先就是激素的问题，胎儿睾丸中产生的激素会影响胎儿男性外生殖器的形成。一般它的形成在胚胎第14周完成，需要双氢睾酮刺激完成，因此如果睾酮产生不足就会导致外生殖器的畸形。另外，环境因素，比如母亲在妊娠的早期用过孕酮，以及冬天受孕的胎儿，容易发生尿道下裂。
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