遗精之后尿道刺痛绝大多数都是由于尿道的相关疾病，如尿道狭窄、尿道炎症等等造成的。药物的选择也要根据这些病因来进行处理，尿道出现炎症的概率是最高的，需要应用抗菌、消炎的治疗药物，如头孢菌素、喹诺酮类消炎药，包括左氧氟沙星、诺氟沙星、莫西沙星等等。
如果疼痛非常严重，还需要应用止痛药物，如布洛芬、双氯芬酸钠、尼美舒利等等。经过详细的检查以及处理之后绝大多数的患者都可以在短时间内好转、治愈。遗精是一种正常的生理现象，如果不存在相关疾病，一般情况下不会引起尿道刺痛。
