尿道下裂手术可能出现并发症，常见的手术后遗症：第一、尿道皮肤瘘，即尿道手术后出现局部漏尿，有时可发现在冠状沟附近，但大多位于阴茎根部修补处漏尿。第二、尿道口狭窄，成形的尿道外口可因瘢痕或缺血，造成挛缩形成狭窄及排尿时费力，尿线较细且排尿时困难等症状。第三、尿道憩室，常常继发于远端尿道梗阻，这时新形成的尿道口内压力增高，周围尿道缺少组织支持而内陷，形成尿道憩室，尿道憩室常并发感染。第四、术后尿频、尿急、尿痛且排尿费力，严重时可出现尿道口脓性分泌物或尿液滴沥不止。第五、阴茎下弯复发，即手术后出现瘢痕挛缩等情况，仍出现阴茎下弯畸形，影响排尿、影响勃起功能，必要时需要再次手术治疗。
