巨细胞病毒IgM阳性，提示体内存在现症巨细胞病毒感染，需要进一步检查巨细胞病毒的DNA，如果血清DNA也是阳性，则可以诊断巨细胞病毒感染。如果患者是健康的人群，免疫功能相对正常，没有严重的基础疾病，症状比较轻，感染通常为自限性，可以不进行抗病毒治疗。如果患者本身是免疫功能低下的人群，病情相对比较长，症状比较突出，这时一般需要进行抗病毒治疗，可以采用更昔洛韦或者口服的缬更昔洛韦进行抗病毒治疗。
无论是免疫功能正常的人群，还是免疫功能低下的人群，经过抗病毒治疗之后，巨细胞病毒通常不会从体内彻底清除，患者的临床症状可以缓解，达到临床治愈。但是病毒可以进入淋巴细胞长期潜伏，在患者免疫功能低下时可以再次激活、引起感染。有严重基础疾病的人群、干细胞移植、器官移植的患者以及长期应用免疫制剂的人群，将来巨细胞病毒再次被激活的几率相对较高，可能引起巨细胞病毒肺炎，也可能引起全身各个系统的受累，需要进行抗病毒治疗。再次激活时IgM出现阳性的几率相对而言较低，血清DNA通常会表现为阳性。
