生化妊娠的主要原因是胚胎自身发育不良，如染色体异常等，也与母亲因素相关，如抗磷脂综合征等疾病，需要查找原因，再给予处理。生化妊娠是最早期的妊娠，胚胎发育尚小，B超还没有证实宫内孕囊时即发生流产，孕囊随着阴道出血排出体外，血HCG开始升高之后逐渐降至正常，称之为生化妊娠。
生化妊娠属于生物界的优胜劣汰现象，如果连续多次流产，需要排除母亲的原因，应检查卵巢功能、内分泌及免疫功能。可能是卵巢黄体功能不足，孕激素较低导致，要补充孕激素。有时与自身免疫性疾病相关，如抗磷脂综合征，下次妊娠后要给予抗凝治疗。
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