部分肺结核只是通过拍胸片不一定能看得出来，甚至还可能会误诊耽误诊断，临床上一般比较特殊的肺结核，比如结核分枝杆菌感染而导致支气管黏膜出现感染而导致的支气管内膜结核。这时通过拍胸片无论是双肺的X光片，还是CT、核磁共振都无法看到肺部明显的病灶而容易误诊。临床上一般结合临床表现，比如结核中毒症状以及做支气管纤维内镜甚至取活组织做病检，才能够明确支气管内膜结核，以防漏诊延误治疗。
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