甲状腺功能亢进症口服药物包括硫脲类及咪唑类，常用甲巯咪唑与丙硫氧嘧啶，甲巯咪唑半衰期较长可以每日单次给药，丙硫氧嘧啶的半衰期较短应每6-8h给药1次。由于丙硫氧嘧啶的致畸风险小于甲巯咪唑，所以妊娠前期一般选择丙硫氧嘧啶。由于抗甲状腺药物会引起白细胞减少及肝功损伤，所以通常会配合升白药物及保肝药物一起服用。由于甲状腺激素升高会导致交感神经兴奋性增强，引起心悸、心率增快，所以还应同时服用心得安等药物控制心率。除了药物治疗之外，甲亢还可以选择碘131及手术方式进行治疗，根据自身情况选择合适治疗方案。
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