甲状腺进行穿刺活检时会感觉到疼痛，但是是可以耐受的范围之内，所以在进行甲状腺活检穿刺的时候并不注射麻药。甲状腺的穿刺活检，在医学上常称为细针穿刺细胞学检查，有些细针穿刺细胞学检查是在超声引导下进行的，而有些细针穿刺细胞学检查没有在超声引导之下进行。
通过细针穿刺细胞学检查，可以明确穿刺部位组织的病理分型，这样为进一步确定患者属于哪一种疾病提供很好的依据，例如当考虑患者为甲状腺癌时，常通过细针穿刺细胞学检查，进一步的明确甲状腺癌这一类诊断。某些疾病如桥本甲状腺炎等确诊时，金标准也是使用细针穿刺细胞学检查来进行确诊。
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