新生儿巨细胞病毒感染目前在临床上是可以治疗的，而且大部分是可以完全治愈的，只要早期发现早期治疗，不会给新生儿留下严重的后遗症。治疗的方法主要是用更昔洛韦，在医生的指导下进行治疗，可以静脉用药，疗程最少将近一个月。如果没有早期治疗，可能会导致新生儿多脏器的病变，如可以发生巨细胞病毒感染而引起胆汁淤积、肝脏损伤、胆管狭窄等等，也有可能会发生眼底的病变或者发生听力损伤，最终有可能会导致小头畸形，也就是神经系统的发育异常。巨细胞病毒感染不必担忧，只要早期确诊，目前临床上使用药物可以治疗的，但在治疗的过程中，要动态的评估各脏器功能损伤的情况。
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