抗甲状腺球蛋白抗体的临床意义就是用来临床诊断桥本甲状腺炎，甲状腺球蛋白是甲状腺滤泡上皮细胞合成的，是甲状腺这个工厂合成甲状腺激素的生产线，碘和酪氨酸就在甲状腺球蛋白上组装成甲状腺激素。如果免疫系统在保护甲状腺的时候不认识甲状腺球蛋白，就会产生防御反应，产生的就是抗甲状腺球蛋白抗体，是自身抗体，如果测定明显的增高，临床就可以诊断桥本甲状腺炎。
桥本甲状腺炎是自身免疫性甲状腺炎的一种，主要是甲状腺被免疫系统误伤了，甲状腺球蛋白抗体可以帮助诊断甲状腺功能减退的时候，是不是自身免疫的损伤所引起。并没有什么药物来降低抗甲状腺球蛋白抗体，因为这个抗体并不是直接损伤甲状腺本身。如果测定甲状腺球蛋白抗体增高，而甲状腺功能正常没有甲状腺激素水平增高或降低，不需要特别的治疗，仅仅是每年做一次甲状腺激素水平的测定，及时了解有没有甲状腺功能的损伤。
另外，甲状腺球蛋白的抗体有可能干扰甲状腺球蛋白的测定，甲状腺球蛋白的测定有的时候非常重要，比如甲状腺癌进行甲状腺全切以后，同时又进行了碘-131治疗，定期检查甲状腺球蛋白的水平，帮助评估有没有复发的风险。如果甲状腺球蛋白水平明显增高，就有可能干扰甲状腺球蛋白的测定，影响判断是否为甲状腺癌复发。
