泌尿外科和男科有一部分疾病是重叠的，大多数医院都是先有了泌尿外科，发展壮大以后逐渐再分出了男科。但是男科随着学科的发展，越来越多的疾病已经和泌尿外科划分了界限，所以泌尿外科目前主要处理肾上腺、肾脏、输尿管、膀胱、前列腺、尿道、睾丸、附睾、精索静脉等各个器官系统的炎症、畸形、结石、肿瘤等疾病。男科与泌尿外科重叠的部分主要是前列腺、睾丸、附睾、精索静脉等方面的疾病，男科更注重于性功能方面的一些治疗，比如勃起功能障碍、早泄，当然不育症方面也是男科的重点，精子质量不佳、婚后不育等这些是男科专科治疗的问题。
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