肛周脓肿是一种通俗的说法，临床上标准的称法是直肠肛管周围脓肿。根据脓肿所处位置与肛提肌的关系，可以分为坐骨肛管间隙脓肿、肛门周围脓肿、高位肌间脓肿、括约肌间隙脓肿或者骨盆直肠间隙脓肿。无论哪一种脓肿，主要病因都是因肛腺感染引起。肛腺开口于肛窦，肛窦位于肛门内外括约肌之间，因为肛窦向上开口成口袋状，存留粪便容易引发肛窦炎。肛窦炎感染以后发作以后，感染向周围蔓延，导致周围的疏松的组织间隙化脓感染，从而出现直肠肛管周围间隙的脓肿。
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