甲减是不能治愈的，需要激素终生的替代治疗，相对于其他疾病是容易的。通常选用的激素是左甲状腺素，也就是L-T4，优点主要是让周围组织L-T4作为激素原，可以在正常生理范围内，继续通过脱碘的机制，保持组织对于T3的需求。治疗目标是让患者临床相关的甲减症状、体征完全消失，让TSH和T4的水平维持在正常范围内。根据患者不同的年龄、病情、体重，可能在用药剂量方面有一定的个体差异，比如儿童因为处于代谢比较旺盛的阶段，可能用药就会剂量稍微大一些。对于老年人各项代谢慢，可能要剂量偏小。对于妊娠期的妇女，可能激素用量也会稍微偏大，因为妊娠期甲减对于胎儿的智力发育是有影响的。
