甲状腺过氧化物酶抗体升高，多见于自身免疫性甲状腺疾病。尤其在桥本氏甲状腺炎和弥漫性甲状腺肿，伴甲状腺功能抗体证实均有可能升高，在桥本氏甲状腺炎时升高的更多一些。这是由于机体把甲状腺变成了抗原，产生了针对甲状腺的自身抗体，大多有抗甲状腺球蛋白抗体、抗微粒体抗体和促甲状腺激素受体抗体。
在桥本氏甲状腺炎时，过氧化物酶抗体、球蛋白抗体、微粒体抗体升高的幅度非常高，而在弥漫性甲状腺肿时可以有轻度的升高。在一些自身免疫性疾病，比如系统性红斑狼疮、多发性肌炎等，这些自身免疫性疾病时也有可能产生抗体过高，就是由于机体针对自身的组织认识不清，而产生的抗体导致疾病发生。发生抗体增高时，要确定是哪一类疾病引起的抗体升高，再给予对症的治疗。
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