艾滋病窗口期和潜伏期是不同的两个时间段，潜伏期包含了窗口期在内，艾滋病窗口期是指艾滋病病毒侵入人体之后，会不断复制并刺激机体免疫系统，产生特异性抗体，经过一段时间的免疫反应，抗体量增多到可以用现有的检查手段检测出来,，这段时间又称为艾滋病的窗口期。窗口期的长短不仅与所用试剂的敏感性有关系，而且也有一定的个体差异。目前艾滋病窗口期最长的是三个月，也就是在艾滋病高危接触三个月后，抗体检出率基本可达100%。
艾滋病的潜伏期又称为无症状期，是指艾滋病病毒侵入人体，到最早出现艾滋病相关临床症状的这段时间，艾滋病潜伏期平均约为8-9年，艾滋病抗体一旦产生后便会终身存在不会消失。所以只要过了窗口期，在潜伏期的任何时候，都可以在感染着血液中检测出艾滋病病毒的抗体。
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