胆碱酯酶是体内代谢的酶。胆碱酯酶降低主要来自于两方面的原因，首先，肝脏方面的疾病，胆碱酯酶主要在肝脏内合成。如果肝脏因为多种原因造成损伤，出现肝脏多种功能下降，比如肝衰竭或者重型肝炎，可能会出现肝脏的合成功能下降，出现胆碱酯酶降低。胆碱酯酶降低的越多，肝脏损伤越重。通常用胆碱酯酶降低的数值，来对肝脏疾病的预后进行一下评估。另外，见于有机磷农药中毒，可以造成胆碱酯酶的活力下降，出现水平降低。根据胆碱酯酶降低的不同程度，可以提示中毒的轻重，指导进一步的治疗。
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