婴儿低血糖主要是由于机体葡萄糖的摄入和消耗不平衡所导致的，引起低血糖的发生有很多原因，有以下几点：
第一、肝糖原储存不足，胎儿肝糖原的储存主要发生在孕期最后的4-8周，特别是临床上常见的早产儿、小胎龄儿，还有低体重儿，这样以后体内的肝糖原相对就少了，婴儿生后代谢所需的能量又比较高，出生后延迟开奶或者摄入不足，就容易发生低血糖。
第二、葡萄糖消耗增加，新生儿患有严重的疾病，比如窒息、肿症、缺血缺氧性脑病、败血症、红细胞增多症、休克等等疾病，都可以使机体代谢增加，葡萄糖的消耗就过多，就导致了低血糖的发生。低血糖发生以后，血糖自然就会降低。
第三、胰岛素水平过高，胰岛素是用来降低血糖的激素，胰岛素水平过高可以引起低血糖的发生。如果妈妈有糖尿病、孕母血糖比较高，这样以后就导致胎儿胰岛素的细胞代偿性增生，胎儿出生后胰岛素水平依旧在高位，就容易发生低血糖。
第四、遗传代谢性疾病，比如新生儿低血糖、新生儿半乳糖血症、糖原贮积症、先天性果糖不耐受等等，都会引起低血糖。
第五、有内分泌疾病也会引起，比如甲状腺功能低下、先天性垂体功能低下，都可以引起低血糖的发生。
第六、一些肝脏疾病、慢性腹泻、营养不良等等，都会造成低血糖发生。
