试管婴儿促排卵方案中，长方案和短方案适用的人群各不同，都有优点和缺点，很难说长方案好还是短方案好。长方案是经典方案，抑制早发LH峰，周期取消率低，并在获卵率和妊娠率方面优于短方案。但是长方案用药时间长，费用增加，卵巢过度刺激率增加。短方案更灵活，用药时间短，但是获卵数目少，临床妊娠率低。短方案常常用于卵巢功能低下的人群，长方案用于卵巢功能正常和卵巢功能低下的人群。现在国内各生殖中心做试管婴儿促排卵方案，采用长方案的更多。
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