腰椎植骨融合术需要牺牲一节到多节的椎间盘组织，通过植骨融合这样就会术后就会损失腰部的活动度，因为腰椎的活动度大部分是靠椎间盘实现的。在腰椎之间植骨融合，它的活动度就会减少，这是一个主要的后遗症。
另外，有可能术中会损伤到神经根、脊髓，术后可能会引起神经根的症状，比如下肢的放射性疼痛、麻木。如果脊髓受伤会引起下肢无力，同时由于植骨融合往往需要牺牲一部分的椎板，要将椎板骨质咬下来植骨，引起腰椎的不稳定或者内固定松动。
