在临床上，肝炎的分类用得最多的是针对病因进行分类。病毒性肝炎，指的是嗜肝病毒感染，包括甲、乙、丙、丁、戊肝。另外，还有其他的病毒可以导致肝脏的损害，出现肝炎，比如汉坦病毒导致的流行性出血热、甲型流感病毒导致的流行性感冒、EB病毒导致的传染性单核细胞增多症等，其他的病毒都有可能导致肝脏的炎症。但是损伤的主要器官并不是肝脏，所以并不成为嗜肝病毒，像饮酒过多可以导致酒精性肝炎；肥胖、2型糖尿病为危险因素的脂肪性肝炎。吃的药物如果是过量或者是损伤肝脏，也可以导致药物性肝炎。自身免疫系统出现针对肝脏的抗体，也可以导致自身免疫性的肝炎。另外，许多遗传的因素，也能够导致肝脏的炎症。
